Muzeum Bursztynu daje nam okazję podziwiania przeróżnych bursztynowych wyrobów – od biżuterii (zarówno w formach współczesnych, jak i w stylizowanych na dawne) poprzez przedmioty użytku codziennego, na prawdziwych dziełach sztuki kończąc - można w nim oglądać również rzeźby z bursztynu. Gabloty zostały ustawione tak, że zaraz obok kawałka surowego bursztynu zobaczyć możemy coś, co z tego bursztynu zostało wykonane.

PAN Muzeum Ziemi z Warszawy wzbogaciło Muzeum Bursztynu o ekspozycję stałą pt. „Bursztyn – jego piękno i dzieje”. W Muzeum Bursztynu przedstawiane są także wystawy czasowe, regularnie odbywają się też lekcje muzealne dla uczniów szkół.
Szczególną atrakcję tego miejsca stanowi Laboratorium Bursztynu. Można w nim – za pomocą urządzenia zwanego spektrometrem – sprawdzić, czy bursztyny stanowiące element naszych kolczyków, pierścieni, naszyjników itd. są prawdziwe. Żadna inna placówka krakowska spektrometru nie posiada, w całej Polsce zaś oprócz spektrometru Muzeum Bursztynu znaleźć można tylko dwa takie przyrządy.